原生動物
　　PROTOZOA

　有色鞭毛綱 Chromonadea
　　ヤコウチュウ Noctiluca scintillans

海綿動物 PORIFERA
　石灰海綿綱
　　ケツボカイメンの1種 Sycon sp.
　　アブラツボロイカン Leucandra abratsbo
　尋常海綿綱 Demospongiae
　　ナミイソカイメン Halichondria panicea
　　エダザラカイメン Callyspongia ramosa
　　カワナシカイメンの仲間 Haliclona spp.
　　キヌトメバリカイメン Suberites sericeus

刺胞動物 CNIDARIA
　花虫綱 Anthozoa
　　モエギイソギンチャクまたはミドリイソギンチャク Anthopleura midori
　　ヨロイイソギンチャク Anthopleura japonica
　　ヒオドシイソギンチャク Anthopleura pacifica
　　コモチイソギンチャク Cnidopus japonica
　　タテジマイソギンチャク Haliplanella luciae
　　シオガマサンゴ Oulangia stockesiana miltoni
　　ヒオドシイソギンチャク Metridium senile
　　ウミサボテン Cavernularia obesa

　十文字クラゲ綱 Staurozoa
　　アサガオクラゲ　Haliclystus auricula
　　ムシクラゲ Stenoscyphus inabai
　　ササキクラゲ Sasakiella cruciformis

　ヒドロ虫綱 Hydrozoa
　　タマクラゲ Cytaeis uchidae
　　キイロウミシバ Sertularella miurensis
　　ニンギョウヒドラ Proboscidactyla flavicirrata
　　エダアシクラゲ Cladonema japonica
　　カギノテクラゲ　Gonionema vertens
　　ヒトツアシクラゲ Hybocodon prolifer
　　ミサキアミネウミヒドラ Stylactaria misakiensis
　　アミネウミヒドラの一種 Stylactaria multigranosi
　　ミウラハイクラゲ 　Staurocladia vallentini
　　カミクラゲ　Spirocodon saltator
　　サルシアクラゲ　Sarsia tubulosa
　　シミコクラゲ Rathkea octopunctata
　　ヒトツアシクラゲ　Hybocodon prolifer
　　シロガヤ　Aglaophenia whiteleggei
　　オワンクラゲ　Aequorea coerulescens
　　クリティアクラゲの一種　Clytia sp.
　　オベリアクラゲの一種　Obelia sp.

環形動物 ANNELIDA
　多毛綱 Polychaeta
　　エラコ Pseudopotamilla occelata
　　キボシイソメ Lumbrineris latreilli
　　ゴカイ Neanthes japonica

触手動物 TENTACULATA
　苔虫綱 Bryozoa
　　ツブナリコケムシ Amathia distans
　　フサコケムシ Bugula neritina
　　チゴケムシ Dakaria subovoidea
　　コブコケムシ Celleporina costazii

　腕足綱 Brachiopoda
　　ミドリシャミセンガイ Lingula anatina

軟体動物 MOLLUSCA
　腹足綱 Gastropoda
　　サルアワビ Tugali gigas
　　コガモガイ Collisella heroldi
　　アオガイ Notoacmea schrenckii
　　コウダカアオガイ Notoacmea concinna
　　コシダカガンガラ Omphalius rustica
　　イボキサゴ vUmbonium moniliferum
　　アラレタマキビガイ Nodilittorina exigua
　　タマキビガイ vLittorina brevicula
　　ツメタガイ Neverita didyma
　　ムシロガイ Niotha livescens
　　ヒメムシロガイ Nassarius multigranosus
　　キヌボラ Reticunassa japonica
　　クロスジムシロガイ Reticunassa fraterculas
　　コナガニシ Fusinus ferrugineus
　　ブドウガイ Haloa japonica
　　アメフラシ Aplysia kurodai
　　カラマツガイ Siphonaria japonica

　二枚貝綱 Bivalvia
　　エゾヒバリガイ Modiolus modiolus difficilis
　　ムラサキインコガイ Septifer virgatus
　　ムラサキイガイ Mytilus edulis
　　ホタテガイ Patinopecten yessoensis
　　フクレユキミノガイ Limaria hakodatensis
　　マガキ Crassostrea gigas
　　コケゴロモガキ Ostrea circumpicta
　　クチバガイ Coecella chinensis
　　キヌマトイガイ Hiatella orientalis
　　ニオガイ Barnea manilensis<br>

　頭足綱 Cephalopoda
　　ヒメイカ Idiosepius pygmaeus paradoxus

節足動物 ARTHROPODA
　甲殻綱 Crustacea
　　イワフジツボ Chthamalus challengeri
　　チシマフジツボ Semibalanus cariosus
　　クロフジツボ Tetraclita squamosa
　　ワレカラの仲間 Caprella spp.
　　ザリガニ Cambaroides japonicus
　　アナジャコ Upogebia major
　　ニホンスナモグリ Callianassa japonica
　　ヨツハモガニ Pugettia quadridens
　　シロナマコマメガニ Pinnixa tumida
　　イワガニ Pachygrapsus crassipes
　　イソガニ Hemigrapsus sanguineus
　　ケフサイソガニ Hemigrapsus penicillatus
　　ヒライソガニ Gaetice depressus

棘皮動物 ECHINODERMATA
　海星綱 Asteroidea
　　モミジガイ Astropecten scoparius
　　スナヒトデ Luidia quinaria
　　イトマキヒトデ Asterina pectinifera
　　エゾヒトデ Aphelasterias japonica
　　ヒトデ Asterias amurensis

　海胆綱 Echinoidea
　　ツガルウニ Glyptocidaris crenularis
　　キタサンショウウニ Temnopleurus hardwicki
　　バフンウニ Hemicentrotus pulcherrimus
　　エゾバフンウニ Strongylocentrotus intermedius
　　キタムラサキウニ Strongylocentrotus nudus
　　ハスノハカシパン Scaphechinus mirabilis
　　オカメブンブク Echinocardium cordatum

　海鼠綱 Holothuroidea
　　マナマコ Stichopus japonicus
　　シロナマコ Paracaudina chilensis ransonneti
　　ウチワイカリナマコ Labidoplax dubia

半索動物門 HEMICHORDATA
　ギボシムシ綱 Enteropneusta
　　ミサキギボシムシ Balanoglossus misakiensis

原索動物 PROTOCHORDATA
　海鞘綱 Ascidiacea
　　シロウスボヤ Didemnum moseleyi
　　ネンエキボヤ Leptoclinum mitsukurii
　　ユウレイボヤ Ciona savignyi
　　マメボヤ Perophora japonica
　　ナツメボヤ Ascidia ahodori
　　スジキレボヤ Ascidia sydneiensis samea
　　ガマグチボヤ Rhodosoma turcicum
　　スボヤ Chelyosoma siboja
　　ウスイタボヤ Botryllus schlosseri
　　イタボヤ Botrylloides violaceus
　　コバンイタボヤ Symplegma reptans
　　エボヤ Styela clava
　　カラスボヤ Pyura vittata<br> ミハエルボヤ Pyura michaelseni
　　マクラボヤ Pyura mirabilis
　　マボヤ Halocynthia roretzi
　　イガボヤ Halocynthia hilgendorfi f.igaboja
　　リッテルボヤ Halocynthia hilgendorfi f.ritteri

脊椎動物 VERTEBRATA
　円口綱 Cyclostomi
　　カワヤツメ Entosphenus japonicus

硬骨魚綱 Osteichthyes
　　ダイナンギンポ Dictyosoma burgeri